В 1990 году президентом клуба стал Владимир Горюнов.

«Ротор» — серебряный призёр чемпионатов России 1993 и 1997 годов, бронзовый призёр чемпионата России 1996 года. Финалист Кубка России 1994/95.

В начале 2005 года был лишён статуса профессионального клуба[1]. В 2006 был возрождён на базе ФК «Ротор-2»[2], который раньше фактически был фарм-клубом «Ротора»[3]. С 2006 года возрождённый «Ротор» выступает во втором дивизионе.

Памятные матчи
12 и 26 сентября 1995 года
В сезоне 95/96 турнира Кубок УЕФА на стадии 1/32 Ротор обошел команду Манчестер Юнайтед по результатам двух встреч. Обе игры закончились вничью: 0:0 в Волгограде и 2:2 в Манчестере, но, по правилу гола, забитого на чужом поле, дальше прошёл Ротор. Игра приобрела статус исторической, причём не только в России, но и за рубежом[4].
2 мая 1943 года
Матч «На руинах Сталинграда».

Достижения
В чемпионатах России: серебро 1993 и 1997, бронза 1996, 4-е место 1994 и 1998.
В Кубках России: финал 1995. Полуфиналы 1992, 1996, 1998, 1999.
В чемпионатах СССР: 4-е место 1939.
В Кубках СССР: полуфинал 1945.
В чемпионатах РСФСР: чемпион 1980.
В Кубке Интертото: финалист 1996.

Рекордсмены
России

Валерий Есипов сыграл 349 матчей.
Олег Веретенников сыграл 247 матчей.
Олег Веретенников забил 141 мяч (200 мячей к 13 апреля 2008 в зачёте Клуба 100).
Владимир Нидергаус забил 68 мячей.
Валерий Есипов забил 84 мяча.
Олег Веретенников забил 25 мячей в чемпионате 1995 года.
СССР

Виктор Матвеев сыграл 180 матчей.
Александр Пономарёв забил 45 мячей.
Александр Пономарёв забил 19 мячей в чемпионате 1938 года.

Известные игроки
Алдонин, Евгений Валерьевич
Бузникин, Максим Евгеньевич
Веретенников, Олег Александрович
Есипов, Валерий Вячеславович
Нидергаус, Владимир Викторович
Осинов, Михаил Святославович
Павлюченко, Роман Анатольевич
Пономарёв, Александр Семёнович
Чичкин, Андрей Григорьевич
Шмарко, Александр Николаевич
Яровенко, Евгений Викторович